Ολοκληρώνοντας την ειδικότητά του και κατόπιν εξέτασης έλαβε τον τίτλο του χειρουργού με "Λίαν Καλώς". Αμέσως μετά ο κος Αποστολάκος ανέλαβε ως Επιμελητής Β’ Χειρουργικής Κλινικής 401 ΓΣΝΑ και την ίδια χρονιά με μετάθεση του στο Διδυμότειχο και κατόπιν πρόσκλησης του διοικητικού συμβουλίου του εκεί νοσοκομείου, ανέλαβε ως Β’ διευθυντής τη χειρουργική κλινική. Στη θέση αυτή παρέμεινε για τέσσερα χρόνια με πληθώρα χειρουργικών επεμβάσεων, εφημεριών, εξωτερικών ιατρείων και χορήγησε έξι μήνες ειδικότητας σε νέους χειρουργούς ενώ πολλές φορές αποτέλεσε το μοναδικό χειρουργό του βόρειου τμήματος του Νομού.
Στη συνέχεια ανέλαβε ως Επιμελητής της Β’ χειρουργικής κλινικής 424 Στρ. Νοσοκομείου. Το 1989 ο κ. Αποστολάκος έλαβε υποτροφία για το Παρίσι. Έτσι, υλοποίησε μετεκπαιδευτικό πρόγραμμα στο Νοσοκομείο Kremlin – Bicetre για τρεις μήνες (Καθηγ. Μ. Testas, αντικείμενο χειρουργική ήπατος - χοληφόρων) και εννέα μήνες στο Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο Antoine Beclere καθηγ. P. Larrieu με αντικείμενο χειρουργική παχέος εντέρου και ενδοκρινών αδένων.
Επιστρέφοντας στην Ελλάδα ανέλαβε τα καθήκοντα του ως Επιμελητής της Β’ χειρουργικής κλινικής 424 Στρ. Νοσοκομείου, Διευθυντής Χειρουργικής Κλινικής Στρ. Νοσοκομείου Ξάνθης 412 και υποδιευθυντής Νοσοκομείου, Διευθυντής Β’ Χειρουργικής Κλινικής 424 Στρ. Νοσοκομείου, Διευθυντής Α’ Χειρουργικής Κλινικής 424 Στρ. Νοσοκομείου, Διευθυντής Υγειονομικού 3ης Ταξιαρχίας Υποστηρίξεως και πρόεδρος της επιτροπής Απαλλαγών Γ’ Σώματος Στρατού.